More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2567 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  73.8 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  53.85 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  52.87 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  54.57 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  52.54 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.57 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  49.86 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1797  tartrate dehydrogenase  51.14 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  51.01 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  52.45 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  51.66 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  49.15 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  51.66 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.66 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.66 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.66 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.66 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.93 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  51.66 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  51.66 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  52.92 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 358 aa  358  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  49.01 
 
 		 357 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  51.13 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  50.7 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  47.74 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  47.61 
 
 		 352 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  48.6 
 
 		 349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  51.4 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  50.86 
 
 		 354 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  48.59 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  50 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  46.74 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  46.74 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.98 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  49.86 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  49.72 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  50.14 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.74 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  49.17 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  48.16 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  48.85 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  48.6 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  48.59 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  49.31 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.01 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  49.15 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.01 
 
 		 347 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4411  tartrate dehydrogenase  47.46 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  49.29 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  46.74 
 
 		 368 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  49.3 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  49.02 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  45.2 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  48.21 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  48.21 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  47.37 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04822  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01160)  47.18 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893828  normal  0.720485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  46.46 
 
 		 376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2247  tartrate dehydrogenase  47.79 
 
 		 361 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  45.61 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5601  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.29 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574649 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  48.14 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  48.46 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  49.72 
 
 		 362 aa  338  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  45.2 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  48.24 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  48.46 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  47.61 
 
 		 358 aa  335  7.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  47.32 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  47.44 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  45.01 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>