More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7787 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.5 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.64 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.25 
 
 		 339 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.89 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.12 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.7 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.57 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.86 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.5 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.07 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.39 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.12 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.53 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.64 
 
 		 350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.12 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.12 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.19 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.89 
 
 		 345 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.52 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.6 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.32 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.39 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.76 
 
 		 361 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.53 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.43 
 
 		 340 aa  424  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.25 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.25 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.38 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.72 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.85 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.61 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.76 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.04 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.38 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.08 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.15 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.89 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.29 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.29 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.48 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  42.49 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  47.03 
 
 		 352 aa  288  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  48.43 
 
 		 350 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  45.3 
 
 		 360 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  45.3 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  45.75 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  45.75 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  45.75 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.41 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  44.34 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.41 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  45.68 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  45.86 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.41 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  47.29 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.41 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.94 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  47.29 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.41 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  44.2 
 
 		 359 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.95 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  45.08 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  44.13 
 
 		 361 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  49.19 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  45.37 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  44.99 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  43.01 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  44.93 
 
 		 361 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  45.87 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  45.97 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.54 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  44.6 
 
 		 361 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.08 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  45.18 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  42.97 
 
 		 365 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  46.93 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  45.18 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  48.23 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  45.77 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  43.09 
 
 		 364 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  43.09 
 
 		 364 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  42.15 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.01 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  47.27 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>