More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1586 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  706    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.86 
 
 		 358 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.91 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.91 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.09 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.55 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  53.01 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.83 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.77 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.68 
 
 		 373 aa  350  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.59 
 
 		 346 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.5 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.92 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.43 
 
 		 354 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.22 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.45 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  46.24 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.7 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.56 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.27 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.83 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.81 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  43.64 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 336 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 336 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 336 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.42 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.69 
 
 		 343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  49.57 
 
 		 364 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.4 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  44.6 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  43.97 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  44.32 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.92 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.41 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.92 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.64 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  45.92 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  45.92 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.92 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 355 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.63 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.83 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  45.63 
 
 		 361 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.66 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.86 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  44.92 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.16 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.2 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44 
 
 		 361 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  45.01 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  44 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.66 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  44.07 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.65 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.72 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  48 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 362 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1797  tartrate dehydrogenase  42.29 
 
 		 360 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.13 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.64 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 396 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 396 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 396 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 361 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  43.55 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.56 
 
 		 478 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  41.62 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  41.71 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.71 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 360 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  42.41 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>