More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6014 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 345 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  87.91 
 
 		 342 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.88 
 
 		 340 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.74 
 
 		 340 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.56 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.12 
 
 		 336 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.12 
 
 		 336 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.12 
 
 		 336 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.86 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.75 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.51 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.8 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.89 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.96 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.06 
 
 		 339 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.77 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.27 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.41 
 
 		 346 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.4 
 
 		 342 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.97 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.92 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.62 
 
 		 354 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.59 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.96 
 
 		 350 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.26 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.06 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.25 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.38 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.67 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.04 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.99 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 353 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.43 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.69 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.38 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.99 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.83 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.58 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.89 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.92 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  48 
 
 		 349 aa  298  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.15 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.1 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.36 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  45.71 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  44.09 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.51 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  45.86 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  43.93 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  44.9 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  46.83 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  45.14 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  47.06 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  47.52 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.09 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  44.97 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  45.86 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  43.4 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  46.06 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  44.03 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  42.57 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  44.34 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  45.33 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  43.14 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  46.35 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  46.2 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 349 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  43.47 
 
 		 360 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  43.08 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.03 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.33 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  47.19 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  47.19 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  42.57 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  46.91 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.57 
 
 		 375 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  44.34 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  43.08 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  43.71 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.43 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.53 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  44.27 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  44.27 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  43.71 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>