More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1536 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 342 aa  682    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 		 348 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.39 
 
 		 346 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.49 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 		 348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.65 
 
 		 361 aa  342  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.85 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 350 aa  338  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.72 
 
 		 336 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.18 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.18 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.18 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.85 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.13 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.09 
 
 		 339 aa  328  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.13 
 
 		 478 aa  328  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.03 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.83 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.52 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.4 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.86 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.68 
 
 		 336 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.74 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.73 
 
 		 354 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.07 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.86 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.4 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.88 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.03 
 
 		 342 aa  301  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.55 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.94 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.69 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.43 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.37 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.04 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  44.96 
 
 		 364 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  43.33 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.18 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.29 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.44 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  43.02 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  47.81 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  42.05 
 
 		 365 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  43.42 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  44.81 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.26 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  41.49 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  46.37 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.65 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  45 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  43.4 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  43.97 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.63 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.46 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.38 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  44.03 
 
 		 359 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.22 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  43.93 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.47 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  43.87 
 
 		 387 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  43.41 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  44.62 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  44.62 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2698  tartrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  43.47 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.03 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  41.54 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  40.83 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1788  tartrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  40.92 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  44.03 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.84 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.06 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1632  tartrate dehydrogenase  43.41 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  44.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  42.48 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  44.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  44.84 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  42.11 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  44.07 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  44.68 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  44.68 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>