More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1098 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 342 aa  668    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  89.77 
 
 		 342 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.67 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.49 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.09 
 
 		 337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.06 
 
 		 336 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.56 
 
 		 340 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.52 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.46 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.46 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.46 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.7 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.26 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.47 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.03 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.47 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.76 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.7 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.34 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.22 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.8 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.42 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.31 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.97 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.92 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.91 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.52 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.57 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.31 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.34 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.83 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.72 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.06 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.01 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.72 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.63 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 		 357 aa  361  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 		 357 aa  361  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.64 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.41 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.85 
 
 		 342 aa  315  7e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.69 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  49.42 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  45.95 
 
 		 358 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  48.12 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.86 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  46.29 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.27 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  46.13 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  47.34 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  45.07 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  44.86 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  44.99 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  44.85 
 
 		 360 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  45.38 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  47.41 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  47.34 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  48.56 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  46.5 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  45.28 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.01 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.9 
 
 		 371 aa  275  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  44.26 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  46.77 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  46.09 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  46.99 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.49 
 
 		 375 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.7 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  48.39 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.26 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.21 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  46.44 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  47.25 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44.99 
 
 		 361 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  47.11 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  47.25 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  44.94 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  44.94 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  47.09 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  44.94 
 
 		 361 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  46.79 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.79 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.79 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.79 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.93 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  49.36 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  46.79 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.8 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  44.82 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.48 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  48.12 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  46.11 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>