More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2209 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 384 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0489  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.3 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0829  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.42 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.05 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.49 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.75 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.31 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.34 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.63 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.62 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  47.11 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.51 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  40.72 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.98 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  40.46 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.12 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  43.26 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 352 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.84 
 
 		 346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  40.46 
 
 		 361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.01 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  40.21 
 
 		 359 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.75 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  41.75 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.75 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  41.75 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.75 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.75 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  40.87 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  38.92 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  39.18 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  39.18 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  39.18 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  41.75 
 
 		 361 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.41 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.54 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  41.75 
 
 		 361 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  40.41 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  40 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.38 
 
 		 339 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  39.74 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  39.69 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  39.79 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  39.79 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  41.21 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  39.79 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.25 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  39.02 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5601  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.56 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  40.31 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.67 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  39.23 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.38 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  40 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  39.32 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  39.69 
 
 		 362 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.25 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.58 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  39.53 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  39.36 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  39.74 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  40.16 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  39.18 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  40.36 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04822  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01160)  40.1 
 
 		 357 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893828  normal  0.720485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  41.06 
 
 		 359 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  41.15 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  40.99 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  44.54 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.04 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  38.4 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.71 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  40.56 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  38.4 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  38.4 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  39.33 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  38.96 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.02 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  39.95 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  39.48 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.02 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.02 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  38.24 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  39.35 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  38.54 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>