More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0489 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0489  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.3 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0829  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.16 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  43.41 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  42.12 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  41.6 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 360 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  41.86 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  42.64 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  40.98 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  41.34 
 
 		 361 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  39.53 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  39.84 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  41.6 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  39.33 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  42.23 
 
 		 357 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  40.83 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.68 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  40 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  40.67 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.86 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  40.47 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  40.83 
 
 		 361 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 373 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  43.68 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  42.97 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  38.72 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  38.72 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  38.72 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2247  tartrate dehydrogenase  40.83 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  40.74 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  39.53 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.41 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.86 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.86 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.64 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  43.77 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  41.79 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  39.27 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  39.39 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  39.94 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  41.11 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  39.13 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 359 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.57 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  39.43 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  38.6 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.31 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  41.19 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  41.71 
 
 		 360 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  41.82 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.71 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  40.36 
 
 		 376 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  41.04 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4411  tartrate dehydrogenase  41.8 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  41.4 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  40.31 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  42.23 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  41.5 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.95 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  40.67 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  39.78 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2698  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.55 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  43.02 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  39.9 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3066  tartrate dehydrogenase  39.69 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0824079  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  39.16 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  42.15 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  41.08 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.1 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  40.98 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1632  tartrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>