More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8042 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.92 
 
 		 348 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.57 
 
 		 354 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.29 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.84 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.29 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.71 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.43 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.86 
 
 		 347 aa  454  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.64 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.64 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.59 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.74 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.55 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.12 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.51 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.65 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.91 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.43 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.64 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.01 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.96 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.5 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.29 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.29 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.29 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.35 
 
 		 342 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.26 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.34 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.4 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.4 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.49 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.29 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.38 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.21 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.31 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.83 
 
 		 355 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.05 
 
 		 358 aa  341  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.77 
 
 		 349 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  50.72 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  48.91 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  45.76 
 
 		 363 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.36 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  46.44 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.39 
 
 		 375 aa  298  7e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.97 
 
 		 371 aa  295  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.74 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  49.84 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  49.84 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.2 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.88 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  45.78 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  47.27 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  48.55 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  48.55 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.55 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.55 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.55 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  48.55 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  48.55 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  47.22 
 
 		 359 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  42.38 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  44.86 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  44.86 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  48.01 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.31 
 
 		 375 aa  285  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  45.79 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  46.29 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  46.11 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.04 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  45.45 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  45.48 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  42.15 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  45.99 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  45.71 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  46.93 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.11 
 
 		 347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.42 
 
 		 351 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  46.45 
 
 		 365 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  48.72 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  45.05 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  45.05 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  45.05 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  45.05 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.6 
 
 		 373 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  49.23 
 
 		 372 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>