More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0829 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0829  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  777    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0489  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.16 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.68 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  42.01 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  42.45 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  42.01 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  41.49 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  41.24 
 
 		 361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  41.6 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  40.52 
 
 		 359 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  41.34 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  41.93 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  41.93 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  41.34 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  41.34 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.93 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  39.38 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.85 
 
 		 351 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  44.41 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.48 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  38.64 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  38.42 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  39.19 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  40.46 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.04 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  39.79 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  37.24 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  37.24 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  37.24 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  39.43 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  40.24 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  39.32 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.1 
 
 		 337 aa  243  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  43.16 
 
 		 350 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  39.54 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  38.62 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.67 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  38.96 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.33 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  41.25 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  39.67 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.67 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.67 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  38.5 
 
 		 362 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.67 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  39.67 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  39.74 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  39.67 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.14 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  39.67 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  38.18 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  39.32 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3176  tartrate dehydrogenase  38.28 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  40.65 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  37.92 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  39.53 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.78 
 
 		 354 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  39.28 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  40.88 
 
 		 365 aa  236  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  38.28 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  38.18 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.95 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  39.02 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.66 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.58 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  40.59 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  38.05 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  40.46 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  37.47 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.16 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.95 
 
 		 353 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  40.22 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  36.88 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  37.85 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  37.28 
 
 		 359 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  39.8 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  41.01 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  38.5 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  36.86 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  38.5 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.68 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.26 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  38.05 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  39.74 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  37.18 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  38.79 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  39.02 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  38.22 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  41 
 
 		 367 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>