More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1704 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  87.61 
 
 		 339 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.83 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.39 
 
 		 347 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.45 
 
 		 354 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.85 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.97 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.71 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.07 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.74 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.03 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.89 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 336 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.05 
 
 		 339 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.95 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.43 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.7 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.14 
 
 		 348 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.7 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.7 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.29 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.34 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.27 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.27 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.98 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.87 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.7 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.34 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.42 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.52 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.61 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.32 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.48 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.8 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.16 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.03 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 357 aa  331  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 357 aa  331  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 358 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.09 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.89 
 
 		 353 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.78 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.73 
 
 		 357 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  46.4 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.38 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  42.78 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  47.34 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  46.88 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.6 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.5 
 
 		 371 aa  272  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  44.6 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.35 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  44.07 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.17 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.85 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  41.78 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  43.06 
 
 		 357 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  44.57 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.96 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.79 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.41 
 
 		 384 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  46.65 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  46.65 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.65 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.65 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.65 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  44.29 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  44.29 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  41.19 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  42.66 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  42.82 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  44.8 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 375 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 376 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.86 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  40.56 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>