More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2812 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.92 
 
 		 348 aa  614  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.93 
 
 		 354 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.5 
 
 		 354 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.28 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.21 
 
 		 353 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.71 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.86 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.14 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.71 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.45 
 
 		 354 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.06 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.25 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.8 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.28 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.43 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.68 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.4 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.05 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.08 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.97 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.91 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.72 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.36 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.36 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.36 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.33 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.25 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.73 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.92 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.2 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.22 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.68 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.19 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 343 aa  394  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.87 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.73 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.76 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.84 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.35 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  51.84 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  48.17 
 
 		 358 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  48.13 
 
 		 363 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.73 
 
 		 357 aa  308  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.21 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  49.08 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.9 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  49.1 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  45.15 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  48.78 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  50.97 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  50.97 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  51.3 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  50.97 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  50.97 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  50.97 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  50.97 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  50.97 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  49.25 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  47.56 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  47.53 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  47.53 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  47.53 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  48.48 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  45.38 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  48.47 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.95 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  47.43 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  46.52 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  47.59 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  48.48 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.14 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  46.7 
 
 		 361 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  47.92 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  45.95 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  47.92 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  47.13 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  46.83 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  45.68 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.24 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.82 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  44.6 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  47.04 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  48.11 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  45.88 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  45.85 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  47.12 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  45.98 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  47.32 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  45.11 
 
 		 361 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  46.07 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  45.98 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>