More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4233 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  93.75 
 
 		 336 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  84.82 
 
 		 336 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  84.82 
 
 		 336 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  84.82 
 
 		 336 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  83.04 
 
 		 336 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.49 
 
 		 337 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.25 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.56 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.96 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.52 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.39 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.96 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.53 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.17 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.17 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.47 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.36 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.64 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.44 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.72 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.9 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.95 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.64 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.4 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.45 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.58 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.48 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.72 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.11 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.75 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.72 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  47.81 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.2 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.38 
 
 		 350 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  43.48 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  45.22 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  45.22 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  47.02 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  46.06 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.91 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  46.32 
 
 		 359 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 359 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.69 
 
 		 363 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  44.17 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  44.05 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  43.75 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  42.52 
 
 		 370 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 360 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  44.89 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.12 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.67 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.23 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  47.08 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  42.2 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  45.57 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.92 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.48 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  46.58 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  43.87 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44.75 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.96 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  43.2 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.13 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.34 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  42.69 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  43.31 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  45.28 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  46.73 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  42.49 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.32 
 
 		 374 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  45.1 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  44.48 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  42.77 
 
 		 362 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  44.95 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  45.54 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  44.93 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.48 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  41.93 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  45.54 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  43.94 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>