More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_08590 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  697    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.14 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.72 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.22 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.77 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.71 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.41 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.44 
 
 		 478 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.88 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.88 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.88 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.38 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.4 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.11 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.87 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.98 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.38 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.12 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.39 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.19 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.25 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.5 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.32 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.71 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.05 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.47 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.91 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.46 
 
 		 342 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 		 354 aa  348  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.88 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.9 
 
 		 342 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.76 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.01 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.18 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.46 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.31 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.46 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.46 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.16 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.99 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  43.14 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.45 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.6 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.86 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  47.02 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  42.06 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.24 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 375 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.15 
 
 		 374 aa  249  7e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.55 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.47 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.24 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.53 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  42.05 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  44.57 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  42.05 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  43.3 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  45.07 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  41.76 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  41.76 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  41.76 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  43.4 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  42.05 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.36 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  45.34 
 
 		 358 aa  242  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3035  tartrate dehydrogenase  44.23 
 
 		 357 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.931781 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  39.89 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  44.24 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  45.43 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.73 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  40.29 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.73 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.73 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.63 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  41.23 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.73 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  42.82 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  41.23 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  41.3 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.41 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  44.86 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  41.83 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3389  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  40.59 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  44.14 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  42.17 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>