More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2363 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  752    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.49 
 
 		 373 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  76.16 
 
 		 374 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  75.34 
 
 		 371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.24 
 
 		 375 aa  552  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.55 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.84 
 
 		 375 aa  522  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.03 
 
 		 375 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.81 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.13 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.54 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.54 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.35 
 
 		 353 aa  345  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.41 
 
 		 349 aa  342  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.01 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.35 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.41 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.97 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.66 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  41.78 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.82 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.76 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.72 
 
 		 348 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  42.09 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.14 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  41.62 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.35 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  41.51 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  42.51 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  40.91 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.8 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  41.44 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  40.21 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  42.51 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  40.54 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.11 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  40.11 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  40.86 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.49 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  38.11 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.96 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.96 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.53 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.63 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  39.47 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.69 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.69 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  40.69 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  40.69 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  40.69 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  40.69 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.01 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  38.77 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  40.28 
 
 		 349 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.98 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.44 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  38.92 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.39 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  38.93 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  39.58 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.32 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  40.59 
 
 		 387 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  39.31 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  41.18 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  40.97 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  39.35 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  40.05 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  40.05 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  40.05 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  38.87 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.55 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.27 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0404  tartrate dehydrogenase  41.48 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  39.14 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  42.23 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  39.15 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  39.3 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1788  tartrate dehydrogenase  39.26 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  38.98 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  39.52 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  39.52 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  37.53 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>