More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5025 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  91.33 
 
 		 347 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5601  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.21 
 
 		 347 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4970  3-isopropylmalate dehydrogenase  79.77 
 
 		 346 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.736304  normal  0.0918819 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.77 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  55.84 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  52.69 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  54.46 
 
 		 350 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  57.14 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  52.31 
 
 		 349 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  52.99 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  51.84 
 
 		 362 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  53.95 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  53.75 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  52.94 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  50.99 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  52.11 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  51.82 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  50.14 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  52.39 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  52.26 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  52.68 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  54.57 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  52.51 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  52.69 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  52.69 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  52.69 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  52.38 
 
 		 359 aa  348  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  51.26 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  51.82 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  52.11 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  53.82 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  51.41 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  52.98 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  49.01 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  51.12 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  50.99 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  52.26 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  49.58 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  50.42 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1797  tartrate dehydrogenase  50.7 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  52.74 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  52.74 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  53.35 
 
 		 376 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  49.86 
 
 		 362 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  52.74 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  50.7 
 
 		 361 aa  342  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  52.84 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  52.84 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  52.84 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  50.71 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  50.85 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  52.84 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  50.85 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  52.84 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4411  tartrate dehydrogenase  49.44 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  52.84 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  50.42 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3176  tartrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  52.84 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  52.57 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  52.6 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  49.86 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  49.15 
 
 		 374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  52.01 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  49.72 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  50.6 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  48.6 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  50.6 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  52.29 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  50.6 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  51.66 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  50.93 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  50.15 
 
 		 359 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  51.99 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  51.68 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  50.91 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  51.22 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  49.02 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  49.72 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  52.22 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  52 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  51.4 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  49.02 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  52.58 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  51.68 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  51.68 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  51.68 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  51.07 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  50 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  51.07 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>