More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  700    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  72 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.86 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.43 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.16 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.22 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.45 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.23 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.08 
 
 		 337 aa  424  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.85 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.52 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.52 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.24 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.52 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.49 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.5 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.55 
 
 		 343 aa  401  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.18 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.35 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.44 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.92 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.32 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  70.83 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.08 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.93 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.64 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.46 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.01 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.92 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.9 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.86 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.69 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.51 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.71 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.31 
 
 		 364 aa  325  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 353 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.97 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.43 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.53 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  46.74 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  44.57 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.32 
 
 		 371 aa  295  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.59 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.23 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  46.02 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  46.86 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.96 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 357 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  43.06 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.46 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.89 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  44.41 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  46.96 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  43.89 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  48.88 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  46.96 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  45.58 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  47.11 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.3 
 
 		 374 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  46.67 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0775  tartrate dehydrogenase  48.43 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.731125  normal  0.188776 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  45.75 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  46.62 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  46.78 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  43.5 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1028  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.20432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  43.13 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  45.87 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.14 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  43.14 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  48.29 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  43.14 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  43.14 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  46.06 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  43.06 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.65 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  45.68 
 
 		 360 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.56 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  43.63 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  42.66 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  43.65 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  45.68 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>