More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00890 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  100 
 
 		 359 aa  736    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04822  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01160)  60.28 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893828  normal  0.720485 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  60.39 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  59.49 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  58.64 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  58.69 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  58.07 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  58.5 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  58.07 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6783  tartrate dehydrogenase  57.51 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4658  tartrate dehydrogenase  57.22 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  57.59 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  56.53 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4411  tartrate dehydrogenase  55.52 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  56.66 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  55.97 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  55.97 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  55.52 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  54.8 
 
 		 360 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0845  tartrate dehydrogenase  55.11 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.558114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  55.11 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  55.43 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  54.86 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  54.86 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.83 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  54.57 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  55.4 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  54.57 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3176  tartrate dehydrogenase  54.83 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000641803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  54.26 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2113  tartrate dehydrogenase  54.24 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00371607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0440  tartrate dehydrogenase  54.73 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  55.08 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  54.67 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  54.73 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  54.86 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.87 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  48.87 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  48.87 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  49.03 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  47.21 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  46.59 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  48.14 
 
 		 363 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  48.19 
 
 		 360 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  46.01 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  49.58 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0442  tartrate dehydrogenase  48.18 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  46.07 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  47.49 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  47.78 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.52 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  47.74 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  47.22 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  47.22 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  45.53 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  45.53 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  45.53 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  45.56 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  48.46 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  47.08 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  45.25 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.24 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  46.22 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  47.58 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1797  tartrate dehydrogenase  45.94 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0306189  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  47.73 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.18 
 
 		 351 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  46.07 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  46.07 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  47.78 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  48.17 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  48.17 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  48.17 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  44.94 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  44.66 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  47.58 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  45.85 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  45.79 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.28 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  47.62 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  46.18 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  47.9 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  46.09 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  45.66 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  45.79 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>