More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1073 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  100 
 
 
337 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  79.28 
 
 
342 aa  565  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  55.19 
 
 
343 aa  372  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.62 
 
 
336 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.44 
 
 
335 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.25 
 
 
335 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.54 
 
 
334 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.18 
 
 
336 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.12 
 
 
333 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.25 
 
 
336 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.47 
 
 
336 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  40.59 
 
 
336 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  40.59 
 
 
336 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  40.59 
 
 
336 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  41.18 
 
 
336 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  40.84 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  39.47 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  40 
 
 
335 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  40 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  40.06 
 
 
336 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.14 
 
 
340 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  40.29 
 
 
335 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.72 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  39.47 
 
 
348 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 
334 aa  242  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.67 
 
 
361 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.37 
 
 
370 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.52 
 
 
331 aa  235  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  38.02 
 
 
359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.42 
 
 
333 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  37.74 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  39.3 
 
 
338 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.74 
 
 
359 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.05 
 
 
336 aa  228  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.87 
 
 
334 aa  227  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  39.29 
 
 
330 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.9 
 
 
337 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.25 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.07 
 
 
335 aa  225  9e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.78 
 
 
364 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.35 
 
 
339 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  36.18 
 
 
385 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.17 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.95 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.13 
 
 
335 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.76 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  37.64 
 
 
370 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.73 
 
 
336 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.1 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.46 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.39 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  37.87 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.69 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  37.91 
 
 
323 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.39 
 
 
330 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.31 
 
 
331 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  37.43 
 
 
379 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.46 
 
 
342 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.16 
 
 
361 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.35 
 
 
343 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.7 
 
 
338 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.19 
 
 
344 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  36.11 
 
 
360 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  36.74 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.31 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.61 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  32.82 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  36.53 
 
 
485 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  34.33 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  34.78 
 
 
478 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.47 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  36.27 
 
 
471 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  34.12 
 
 
456 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  36.39 
 
 
482 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  33.73 
 
 
367 aa  193  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.05 
 
 
362 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  36.39 
 
 
482 aa  193  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.84 
 
 
325 aa  192  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.57 
 
 
326 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  34.58 
 
 
480 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.3 
 
 
325 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  34.59 
 
 
481 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.59 
 
 
360 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.06 
 
 
345 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  35.88 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  34.6 
 
 
482 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.69 
 
 
360 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  34.3 
 
 
480 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.13 
 
 
360 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.13 
 
 
360 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.99 
 
 
343 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>