More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2980 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  92.84 
 
 		 335 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  93.13 
 
 		 335 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  93.43 
 
 		 335 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  93.15 
 
 		 336 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  93.13 
 
 		 335 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  93.73 
 
 		 335 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  94.03 
 
 		 336 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  93.15 
 
 		 336 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  93.15 
 
 		 336 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  93.73 
 
 		 336 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  93.13 
 
 		 335 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  93.13 
 
 		 335 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  93.45 
 
 		 336 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  93.73 
 
 		 335 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  92.56 
 
 		 336 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  82.69 
 
 		 335 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  80.6 
 
 		 335 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  80.3 
 
 		 335 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  67.16 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  64.26 
 
 		 335 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  62.76 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  62.76 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  64.48 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  62.28 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.55 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  53.89 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.52 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.87 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.61 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  53.66 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.08 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  52.24 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  53.13 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.76 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.49 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.7 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 		 331 aa  335  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.66 
 
 		 364 aa  328  6e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.49 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.65 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.35 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.49 
 
 		 361 aa  322  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.84 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.21 
 
 		 344 aa  315  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  46.43 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  43.26 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  46.71 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50.15 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  44.38 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.05 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  47.21 
 
 		 487 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.45 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  44.18 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  43.86 
 
 		 481 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 482 aa  277  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.51 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.28 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.91 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 482 aa  273  3e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  42.69 
 
 		 478 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  43.27 
 
 		 480 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.31 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  44.12 
 
 		 472 aa  272  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.7 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.7 
 
 		 335 aa  271  9e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.81 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.73 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.21 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.12 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.38 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 		 339 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.03 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.67 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  42.73 
 
 		 480 aa  265  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  41.81 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  43.67 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  41.74 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 471 aa  256  3e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.1 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  41.67 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.2 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  40.95 
 
 		 482 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.64 
 
 		 360 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.06 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.64 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.56 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  42.01 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  41.06 
 
 		 483 aa  246  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.84 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.35 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.09 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.17 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>