More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0248 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  689    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  57.14 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.63 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.71 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.42 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.18 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.07 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.49 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.48 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.87 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.89 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.66 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.6 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.6 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.04 
 
 		 362 aa  278  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.83 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.18 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.02 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.73 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.02 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.91 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.12 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.57 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  42.98 
 
 		 360 aa  258  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.19 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.77 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.82 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.11 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.65 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  45.18 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  44.68 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  44.68 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  44.68 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  43.64 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.58 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  43.77 
 
 		 335 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  43.77 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.64 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  44.55 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  41.34 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  43.03 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.77 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.08 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  43.47 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  43.16 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.65 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  43.47 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.86 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.77 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  43.16 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.25 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.45 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.23 
 
 		 348 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  42.12 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.03 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.46 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  42.3 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.46 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  40.17 
 
 		 361 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  38.95 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.38 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  40.34 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  43.33 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.47 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  39.83 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0014  tartrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0011  tartrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1518  tartrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0015  tartrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.582572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.14 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  39.13 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  37.13 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  39.17 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.04 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  39.88 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  41.3 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.4 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  42.99 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  40.4 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  39.64 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.85 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.42 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  39.48 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>