More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1458 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  675    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.86 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 
334 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.03 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.62 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.62 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.62 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.4 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.02 
 
 
362 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.43 
 
 
337 aa  296  4e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  47.93 
 
 
335 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  291  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  291  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  46.75 
 
 
336 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.34 
 
 
348 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.15 
 
 
360 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  46.75 
 
 
335 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  46.75 
 
 
335 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
335 aa  288  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
335 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
335 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
335 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  47.93 
 
 
336 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  46.45 
 
 
335 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  46.75 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.18 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.45 
 
 
330 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  45.86 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.07 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  45.56 
 
 
335 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.11 
 
 
330 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.96 
 
 
332 aa  278  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.81 
 
 
330 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.01 
 
 
333 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
335 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.91 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.13 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.13 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.05 
 
 
326 aa  268  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.74 
 
 
330 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.45 
 
 
336 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  44.6 
 
 
370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.15 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  46.13 
 
 
335 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  44.07 
 
 
323 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.27 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 
334 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.77 
 
 
338 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.65 
 
 
340 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.82 
 
 
337 aa  256  3e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  44.92 
 
 
360 aa  256  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.2 
 
 
361 aa  256  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  45.88 
 
 
335 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.09 
 
 
377 aa  255  8e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.13 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.5 
 
 
345 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.11 
 
 
335 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.28 
 
 
361 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.31 
 
 
342 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.24 
 
 
336 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  40.71 
 
 
385 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.28 
 
 
325 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.4 
 
 
370 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.34 
 
 
325 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  46.59 
 
 
338 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  47.9 
 
 
344 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  38.89 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.14 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  38.89 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.17 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.9 
 
 
325 aa  242  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.45 
 
 
360 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.09 
 
 
331 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.64 
 
 
343 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.38 
 
 
321 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.83 
 
 
325 aa  239  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.21 
 
 
322 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.7 
 
 
336 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.63 
 
 
329 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  41.33 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.42 
 
 
337 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.05 
 
 
343 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  40.24 
 
 
370 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  38.05 
 
 
367 aa  230  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.49 
 
 
356 aa  229  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.95 
 
 
326 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.59 
 
 
336 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.31 
 
 
326 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.99 
 
 
357 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.27 
 
 
355 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.81 
 
 
342 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.83 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.51 
 
 
359 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  41.81 
 
 
487 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.72 
 
 
345 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>