More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2064 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  644    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  86.46 
 
 
325 aa  558  1e-158  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  87.69 
 
 
325 aa  558  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  88.92 
 
 
325 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  54.18 
 
 
335 aa  333  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  51.71 
 
 
336 aa  318  9e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.74 
 
 
337 aa  306  3e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.59 
 
 
336 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.08 
 
 
326 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.67 
 
 
330 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.77 
 
 
330 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.77 
 
 
330 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.47 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.92 
 
 
334 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  41.39 
 
 
331 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.12 
 
 
335 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.28 
 
 
333 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.51 
 
 
326 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.71 
 
 
332 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.1 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.18 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
339 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.22 
 
 
337 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.45 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
335 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
335 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
335 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
335 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.85 
 
 
336 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
339 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.12 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
336 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  41.49 
 
 
335 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.07 
 
 
336 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
336 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
336 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.84 
 
 
335 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
336 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  42.15 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.41 
 
 
331 aa  236  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  44.06 
 
 
323 aa  235  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.74 
 
 
336 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 
338 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
336 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.15 
 
 
340 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.18 
 
 
339 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 
335 aa  232  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.2 
 
 
326 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 
335 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.45 
 
 
333 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.58 
 
 
327 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.62 
 
 
331 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.57 
 
 
362 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.55 
 
 
348 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.16 
 
 
336 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.64 
 
 
360 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.44 
 
 
358 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 
335 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2885  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.69 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 
335 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.88 
 
 
331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  39.38 
 
 
335 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.5 
 
 
370 aa  222  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  38.12 
 
 
335 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.95 
 
 
364 aa  221  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  38.12 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.35 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.35 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.76 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.95 
 
 
361 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  39.35 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.74 
 
 
343 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  42.68 
 
 
332 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.98 
 
 
356 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.31 
 
 
348 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.51 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.31 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.1 
 
 
359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.78 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9120  tartrate dehydrogenase  37.61 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.33 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  37.46 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.6 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.74 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  38.19 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.53 
 
 
377 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.79 
 
 
356 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.94 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  37.39 
 
 
360 aa  211  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.56 
 
 
321 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.29 
 
 
357 aa  211  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  38.68 
 
 
377 aa  211  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  41.51 
 
 
335 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  38.3 
 
 
374 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  37 
 
 
336 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.49 
 
 
345 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.57 
 
 
359 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.76 
 
 
355 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>