More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0855 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  100 
 
 		 323 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.73 
 
 		 322 aa  338  9e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.8 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.2 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.5 
 
 		 321 aa  331  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.94 
 
 		 325 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.39 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.39 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.19 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.79 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  47.04 
 
 		 343 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.57 
 
 		 332 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.53 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.43 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.81 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.85 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.28 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  44.58 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.29 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.5 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.92 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.46 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 335 aa  265  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.75 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.99 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  44.12 
 
 		 340 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  44.32 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  46.15 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.07 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 336 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.83 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.24 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.24 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.45 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  41.92 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  41.36 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.53 
 
 		 370 aa  252  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  42.47 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.35 
 
 		 337 aa  248  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  40.83 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.57 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.96 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.56 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.77 
 
 		 348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.91 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.03 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.47 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  41.44 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  41.44 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.91 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.06 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.74 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.24 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.34 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  42.15 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.08 
 
 		 344 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  40.63 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  40.57 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.68 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  41.95 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.31 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.62 
 
 		 364 aa  225  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  41.88 
 
 		 360 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.41 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3388  putative isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase / tartrate dehydrogenase ttuC  41.88 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  41.76 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  39.16 
 
 		 343 aa  223  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0182  tartrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  40.06 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.03 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  43.37 
 
 		 335 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  39.53 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  45 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.12 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  38.63 
 
 		 396 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04003  tartrate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04150)  39.71 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.538835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.54 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.04 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  40 
 
 		 481 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.17 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.14 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.55 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>