More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2738 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 335 aa  680    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  71.94 
 
 		 334 aa  498  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.86 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.21 
 
 		 331 aa  341  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.7 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 362 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.4 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.92 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.71 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.92 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.33 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.36 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 		 326 aa  299  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  48.82 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.1 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  48.52 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  48.22 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  46.55 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.06 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  49.11 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.8 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  46.5 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.89 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.09 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  46.41 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  47.85 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.02 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  44.84 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  44.44 
 
 		 370 aa  270  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  45.13 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.84 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.47 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  43.54 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  43.79 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.58 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.51 
 
 		 336 aa  261  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.62 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.28 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.41 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.47 
 
 		 361 aa  258  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  42.34 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.65 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.42 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.77 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  46.41 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.12 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.46 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  45.16 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  45 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  42.18 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  42.18 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  42.13 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  42.09 
 
 		 359 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.99 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  42.18 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  42.18 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.18 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.18 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  46.31 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.18 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  41.9 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  41.81 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.31 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  42.37 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  40.83 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  38.31 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  41.11 
 
 		 360 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  39.72 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  41.53 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.06 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.26 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.84 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.82 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  40.72 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  40.56 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  40.74 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.02 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.85 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  41.85 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.4 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>