More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0870 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  649    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.1 
 
 
326 aa  454  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.7 
 
 
327 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.17 
 
 
326 aa  425  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  66.87 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50 
 
 
330 aa  325  9e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50.15 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  50.15 
 
 
330 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.64 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.19 
 
 
331 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.9 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.94 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.31 
 
 
335 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.22 
 
 
332 aa  262  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.52 
 
 
337 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.44 
 
 
360 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.76 
 
 
336 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.33 
 
 
338 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  42.06 
 
 
335 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.07 
 
 
336 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.07 
 
 
336 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.08 
 
 
321 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  41.07 
 
 
336 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.79 
 
 
362 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.54 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  40.88 
 
 
335 aa  242  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.18 
 
 
335 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.94 
 
 
336 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  40.36 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 
339 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.94 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40 
 
 
336 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.64 
 
 
339 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.68 
 
 
325 aa  236  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.53 
 
 
335 aa  235  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.82 
 
 
336 aa  235  7e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  39.71 
 
 
336 aa  235  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.65 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.96 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  39.88 
 
 
336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.3 
 
 
335 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  41.49 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.82 
 
 
334 aa  231  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.17 
 
 
325 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  41.93 
 
 
360 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.17 
 
 
331 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  38.95 
 
 
335 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.42 
 
 
337 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.6 
 
 
336 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.68 
 
 
325 aa  226  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.68 
 
 
325 aa  226  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.67 
 
 
322 aa  225  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.4 
 
 
343 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.71 
 
 
334 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.94 
 
 
336 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  37.94 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  40 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.08 
 
 
336 aa  220  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.17 
 
 
333 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  38.06 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.76 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.09 
 
 
348 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  37.54 
 
 
385 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  36.84 
 
 
335 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  38.48 
 
 
340 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  39.78 
 
 
349 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  36.84 
 
 
335 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.53 
 
 
364 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  38.1 
 
 
370 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  36.76 
 
 
367 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  39.24 
 
 
334 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.89 
 
 
361 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  36.55 
 
 
335 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.53 
 
 
331 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  39.44 
 
 
352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.5 
 
 
337 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  38.11 
 
 
359 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.83 
 
 
358 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.14 
 
 
370 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.65 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  38.75 
 
 
349 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  39.15 
 
 
350 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  40.59 
 
 
335 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.21 
 
 
361 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.64 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  36.97 
 
 
360 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.46 
 
 
348 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  38.1 
 
 
352 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  36.13 
 
 
374 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.36 
 
 
343 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  36.29 
 
 
360 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  36.29 
 
 
360 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.29 
 
 
356 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  36.84 
 
 
360 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.98 
 
 
343 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>