More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3600 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  660    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.6 
 
 
362 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.45 
 
 
360 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 
331 aa  348  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.45 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.64 
 
 
334 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.67 
 
 
330 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.67 
 
 
330 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.07 
 
 
330 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.43 
 
 
339 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.13 
 
 
339 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.84 
 
 
339 aa  288  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.37 
 
 
331 aa  286  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.96 
 
 
333 aa  278  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  45.57 
 
 
323 aa  278  9e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.35 
 
 
337 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.55 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.15 
 
 
330 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.4 
 
 
343 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.45 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.33 
 
 
322 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 
335 aa  266  4e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.91 
 
 
337 aa  266  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.24 
 
 
326 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  42.58 
 
 
377 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  44.07 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  43.37 
 
 
370 aa  258  9e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.82 
 
 
338 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.14 
 
 
334 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.47 
 
 
325 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.56 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  48.22 
 
 
332 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  40.95 
 
 
336 aa  248  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.25 
 
 
336 aa  248  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  44.81 
 
 
335 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  41.96 
 
 
335 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.71 
 
 
325 aa  247  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.21 
 
 
325 aa  247  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.9 
 
 
336 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.47 
 
 
333 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
335 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  41.37 
 
 
335 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  40.36 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  40.36 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  40.36 
 
 
336 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  42.23 
 
 
340 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.36 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 
335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.56 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.61 
 
 
325 aa  243  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.83 
 
 
336 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.81 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.25 
 
 
336 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 
335 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.84 
 
 
335 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  42.43 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.49 
 
 
336 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.9 
 
 
344 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  45.7 
 
 
334 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.3 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.35 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.53 
 
 
336 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 
335 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.09 
 
 
336 aa  230  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.24 
 
 
327 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  44.97 
 
 
338 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.18 
 
 
348 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.28 
 
 
326 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
335 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.12 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.83 
 
 
359 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.5 
 
 
343 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.46 
 
 
361 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  39.65 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.66 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.75 
 
 
344 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 
360 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  39.94 
 
 
357 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.07 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.36 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.46 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  38.11 
 
 
480 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.19 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.77 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.57 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4411  tartrate dehydrogenase  39.06 
 
 
357 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.62 
 
 
357 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.5 
 
 
353 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  37.97 
 
 
481 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4630  tartrate dehydrogenase  38.5 
 
 
357 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.93 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.72 
 
 
345 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>