More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0525 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  100 
 
 
335 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  72.16 
 
 
334 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  69.16 
 
 
336 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  66.97 
 
 
336 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  62.05 
 
 
361 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  59.61 
 
 
359 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  59.61 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  59.05 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  63.58 
 
 
336 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  59.02 
 
 
331 aa  411  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.67 
 
 
331 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  55.33 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.78 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  54.65 
 
 
348 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  55.76 
 
 
335 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.03 
 
 
364 aa  384  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  55.45 
 
 
336 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  55.45 
 
 
336 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  55.45 
 
 
336 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  54.55 
 
 
336 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  54.85 
 
 
335 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  55.15 
 
 
335 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.38 
 
 
333 aa  381  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  54.55 
 
 
335 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  54.85 
 
 
335 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  55.15 
 
 
336 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  54.55 
 
 
336 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  54.85 
 
 
335 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  54.85 
 
 
335 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  54.55 
 
 
335 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  54.24 
 
 
336 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  55.06 
 
 
361 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.95 
 
 
348 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  55.15 
 
 
336 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  52.57 
 
 
335 aa  362  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  50.91 
 
 
335 aa  361  8e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.59 
 
 
389 aa  360  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  51.66 
 
 
335 aa  358  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  48.49 
 
 
385 aa  353  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  55.15 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  51.94 
 
 
335 aa  348  9e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  51.94 
 
 
335 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  53.17 
 
 
335 aa  346  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  54.44 
 
 
335 aa  337  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  49.1 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  50.3 
 
 
487 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.5 
 
 
342 aa  325  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  49.4 
 
 
338 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.2 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.62 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  49.28 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  47.01 
 
 
367 aa  317  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  48.67 
 
 
478 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.42 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  47.16 
 
 
481 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  48.5 
 
 
439 aa  309  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.7 
 
 
330 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  48.37 
 
 
456 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  48.66 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  47.46 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.4 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50.45 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  45.92 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  48.49 
 
 
330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.86 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.4 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  60.16 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.1 
 
 
335 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  47.48 
 
 
485 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.51 
 
 
370 aa  297  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  47.62 
 
 
331 aa  296  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.51 
 
 
343 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.51 
 
 
425 aa  288  8e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  44.41 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 
471 aa  284  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  44.57 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.92 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.25 
 
 
330 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.97 
 
 
425 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.96 
 
 
343 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.18 
 
 
326 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.97 
 
 
425 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.7 
 
 
336 aa  280  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.15 
 
 
336 aa  276  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  42.18 
 
 
380 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  46.53 
 
 
323 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.67 
 
 
438 aa  275  5e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.67 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.06 
 
 
342 aa  271  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.31 
 
 
345 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  42.65 
 
 
482 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.45 
 
 
344 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.01 
 
 
434 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  42.14 
 
 
482 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1842  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.37 
 
 
439 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.282265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.67 
 
 
411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.91 
 
 
380 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.6 
 
 
385 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1672  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.09 
 
 
438 aa  263  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.789911  normal  0.0375366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>