More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0898 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 327 aa  641    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.32 
 
 		 326 aa  531  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  74.7 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.5 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  70.64 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.98 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.98 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  51.37 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.54 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  49.7 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.31 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.42 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.75 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.81 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.11 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.53 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.56 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.13 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.53 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.58 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.36 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.38 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.2 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.32 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.99 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.69 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.58 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  41.99 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.44 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  41.99 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.99 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.79 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.24 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40.79 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.58 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  43.03 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.88 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.44 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.14 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.1 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.65 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  41.07 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.52 
 
 		 335 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.77 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  39.76 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  41.9 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.24 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  40.22 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.6 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.69 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.84 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.62 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.73 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.59 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  39.35 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.33 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  38.69 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  38.69 
 
 		 335 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  40.56 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  40.23 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.99 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  37.24 
 
 		 385 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  40.62 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  41.67 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.02 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.11 
 
 		 364 aa  212  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.42 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.88 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.62 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.66 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  40.23 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.28 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  38.1 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1031  Tartrate decarboxylase  39.47 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  39.11 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.03 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.78 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.13 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.39 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  39.94 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.3 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  39.19 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  41 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.4 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>