More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1102 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  100 
 
 		 334 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  76.35 
 
 		 336 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  72.16 
 
 		 335 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  68.47 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  58.61 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  62.69 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  55.15 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  55.15 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.43 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.45 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  56.63 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.96 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  55.93 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.06 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.26 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  55.62 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.38 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.19 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  53.43 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  55.22 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  52.87 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  55.22 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  52.24 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  52.38 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  52.38 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  51.94 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  52.68 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  52.38 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  53.13 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  52.84 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  52.54 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  57.19 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  55.22 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.61 
 
 		 389 aa  356  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  50.9 
 
 		 335 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  50 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  49.7 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  48.49 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  53.71 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  53.48 
 
 		 335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  52.55 
 
 		 487 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.94 
 
 		 342 aa  326  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  48.19 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.28 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.17 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  44.31 
 
 		 367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  47.62 
 
 		 478 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.93 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  48.07 
 
 		 485 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.82 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  46.27 
 
 		 481 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  49.02 
 
 		 480 aa  295  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  45.56 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  46.29 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  58.94 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.35 
 
 		 334 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.53 
 
 		 370 aa  287  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  45.54 
 
 		 482 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  45.37 
 
 		 480 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.68 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50.74 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  44.12 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.15 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  50.75 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.26 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  45.29 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.15 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.67 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.23 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.4 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.77 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.85 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.02 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  43.46 
 
 		 471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.91 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.56 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  45.35 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.48 
 
 		 331 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  42.16 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  42.4 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  40.62 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  40.87 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.13 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 416 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 417 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  42.74 
 
 		 382 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.87 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  40.62 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>