More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2464 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  84.03 
 
 		 382 aa  664    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  777    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3476  isocitrate dehydrogenase (NADP)  78.53 
 
 		 382 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.99614  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  71.13 
 
 		 380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  70.16 
 
 		 385 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0439  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  69.58 
 
 		 386 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.364858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.58 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  55.47 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.89 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.84 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.35 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.32 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.58 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  55.39 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.29 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.58 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  56.48 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  54.64 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  56.48 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  55.47 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.05 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  53.94 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.44 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  53.63 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.69 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  53.63 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  55.04 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.53 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.17 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  55.84 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  55.22 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.78 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  54.71 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2139  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.73 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000111217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  54.97 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  54.96 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.79 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  54.47 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.79 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0618  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.19 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.71 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  54.9 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  53.89 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  54.19 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  53.95 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  53.95 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 416 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  53.4 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  54.57 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 416 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  54.19 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  53.37 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  53.4 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  54.15 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  53.89 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  53.63 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  53.37 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  53.4 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  52.88 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  53.89 
 
 		 416 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  53.37 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  53.37 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  53.37 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  52.62 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.11 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  53.12 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  52.59 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  54.19 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  52.88 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  52.85 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  53.91 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0314  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.44 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.839134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  52.33 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  53.11 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1881  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.2 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.328566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  52.88 
 
 		 419 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>