More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0172 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  965    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  53.05 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  53.68 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  53.24 
 
 		 482 aa  485  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  51.98 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  51.26 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  50.21 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  48.2 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  48.41 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  48.11 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  49.23 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  38.84 
 
 		 487 aa  302  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.9 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.02 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.46 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.27 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  40.18 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.41 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.9 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 336 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  40.18 
 
 		 335 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.97 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  42.43 
 
 		 336 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.72 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.98 
 
 		 336 aa  250  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  39.29 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.88 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.72 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  42.53 
 
 		 335 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.67 
 
 		 361 aa  244  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  42.21 
 
 		 335 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  41.69 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.3 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  44.16 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.76 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 335 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  36.93 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  38.99 
 
 		 335 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  36.65 
 
 		 359 aa  238  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.65 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  38.28 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  38.35 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  42.14 
 
 		 379 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  41.94 
 
 		 335 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.4 
 
 		 337 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.04 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.88 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  37.98 
 
 		 323 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.44 
 
 		 331 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.75 
 
 		 337 aa  210  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  34.28 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.55 
 
 		 335 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.96 
 
 		 330 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.65 
 
 		 342 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  41.04 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.04 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.96 
 
 		 330 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.95 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.4 
 
 		 332 aa  199  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.61 
 
 		 339 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.84 
 
 		 339 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.17 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.26 
 
 		 339 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  38.49 
 
 		 362 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3096  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.68 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000077544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.27 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.11 
 
 		 335 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1463  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.5 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00933786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.95 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.43 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.31 
 
 		 331 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0549  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.92 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.54 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.04 
 
 		 333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.6 
 
 		 343 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  37.5 
 
 		 343 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.38 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.69 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1244  isocitrate dehydrogenase  36.91 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.484015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.07 
 
 		 345 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0703  isocitrate dehydrogenase  34.02 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0523745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.18 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.67 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.33 
 
 		 360 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.54 
 
 		 329 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>