More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0166 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  753    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 
403 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  42.05 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  41.14 
 
 
615 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  41.14 
 
 
615 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1368  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.76 
 
 
420 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.24 
 
 
396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.51 
 
 
335 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.53 
 
 
334 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.16 
 
 
361 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.9 
 
 
336 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  42.03 
 
 
336 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  42.03 
 
 
336 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  42.03 
 
 
336 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.48 
 
 
336 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  41.99 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  42.31 
 
 
336 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  41.93 
 
 
359 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.56 
 
 
339 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  42.06 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  41.27 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  39.41 
 
 
340 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.37 
 
 
337 aa  268  8e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  40.44 
 
 
335 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.45 
 
 
359 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.13 
 
 
339 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  41.6 
 
 
359 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.71 
 
 
333 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  41.78 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  40.95 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.38 
 
 
336 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.47 
 
 
335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  38.8 
 
 
335 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  38.8 
 
 
335 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.01 
 
 
331 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.13 
 
 
339 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  40.71 
 
 
336 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  41.53 
 
 
334 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.55 
 
 
336 aa  262  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.44 
 
 
334 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  41.46 
 
 
330 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  40 
 
 
335 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.82 
 
 
331 aa  259  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.92 
 
 
330 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40.92 
 
 
330 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.84 
 
 
337 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.29 
 
 
326 aa  256  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  40.38 
 
 
343 aa  256  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  38.67 
 
 
335 aa  255  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  39.39 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  38.53 
 
 
323 aa  252  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  40.93 
 
 
338 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.9 
 
 
348 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.4 
 
 
333 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.95 
 
 
331 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.78 
 
 
321 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.13 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.78 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.03 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.97 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.42 
 
 
334 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.37 
 
 
337 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  40 
 
 
330 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.12 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.48 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.5 
 
 
329 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.3 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.24 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  39.83 
 
 
335 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.47 
 
 
338 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  35.73 
 
 
377 aa  229  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.02 
 
 
375 aa  229  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  36.88 
 
 
360 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.89 
 
 
357 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.89 
 
 
357 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.68 
 
 
371 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.7 
 
 
364 aa  226  6e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.95 
 
 
361 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.21 
 
 
374 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.06 
 
 
364 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.5 
 
 
325 aa  222  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.94 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.55 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.34 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.79 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.24 
 
 
355 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.89 
 
 
389 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.44 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.07 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.06 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.5 
 
 
375 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.32 
 
 
344 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.36 
 
 
345 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.73 
 
 
358 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>