More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1368 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1368  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
420 aa  877    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.76 
 
 
370 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.53 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.46 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.06 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  36.86 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  39.88 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.02 
 
 
396 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.65 
 
 
337 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.93 
 
 
334 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.34 
 
 
334 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  35.62 
 
 
359 aa  216  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  35.88 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.48 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.48 
 
 
339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  35.62 
 
 
359 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.07 
 
 
335 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  36.71 
 
 
487 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.16 
 
 
615 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.1 
 
 
337 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  33.08 
 
 
615 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  34.9 
 
 
339 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.28 
 
 
331 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.96 
 
 
389 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.29 
 
 
335 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  35.25 
 
 
364 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.22 
 
 
331 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.86 
 
 
336 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.06 
 
 
330 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  33.95 
 
 
340 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.95 
 
 
343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.59 
 
 
330 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.07 
 
 
333 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.23 
 
 
360 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.01 
 
 
348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.02 
 
 
333 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  34.76 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  34.76 
 
 
335 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.29 
 
 
330 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.21 
 
 
331 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.57 
 
 
326 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.47 
 
 
342 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  35.82 
 
 
335 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.4 
 
 
332 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  32.86 
 
 
348 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  34.3 
 
 
482 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  34.71 
 
 
335 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.45 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  34.02 
 
 
335 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  32.55 
 
 
485 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.76 
 
 
362 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.91 
 
 
336 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  31.94 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  33.87 
 
 
334 aa  183  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.36 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  33.92 
 
 
335 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.8 
 
 
361 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  33.82 
 
 
336 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.97 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 
335 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  33.53 
 
 
335 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  33.23 
 
 
335 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  34.72 
 
 
345 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  33.53 
 
 
335 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  33.53 
 
 
335 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  33.53 
 
 
335 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.09 
 
 
337 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  33.63 
 
 
336 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  33.63 
 
 
336 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  34.17 
 
 
336 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  33.63 
 
 
336 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  33.53 
 
 
335 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  33.63 
 
 
336 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.1 
 
 
357 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.1 
 
 
357 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.9 
 
 
434 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  31.96 
 
 
385 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.88 
 
 
425 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.98 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.67 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.39 
 
 
358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.66 
 
 
420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  37.65 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  32.83 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.06 
 
 
353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.69 
 
 
346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  31.91 
 
 
367 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  31.73 
 
 
456 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.67 
 
 
331 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.01 
 
 
334 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  30.61 
 
 
428 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.61 
 
 
427 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.23 
 
 
339 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.47 
 
 
343 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  31.36 
 
 
335 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  30.38 
 
 
413 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.68 
 
 
325 aa  169  9e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.25 
 
 
345 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>