More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0788 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  100 
 
 		 361 aa  740    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  68.25 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  67.97 
 
 		 359 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  67.69 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  62.05 
 
 		 335 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  58.61 
 
 		 334 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  56.3 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  59.33 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.22 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  56.94 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  54.47 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  52.79 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.11 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.12 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.65 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.65 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  51.52 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.4 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  69.92 
 
 		 246 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  48.45 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  48.76 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  48.87 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  47.34 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  49.86 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  47.75 
 
 		 336 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 336 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  49.01 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.35 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  48.31 
 
 		 336 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50 
 
 		 342 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  49.7 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  49.7 
 
 		 335 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  49.11 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  47.91 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  45.4 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  50.6 
 
 		 335 aa  315  7e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.45 
 
 		 411 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.44 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  45.96 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  51.96 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.68 
 
 		 417 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  47.92 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  45.62 
 
 		 367 aa  298  8e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.45 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.56 
 
 		 434 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  44.11 
 
 		 482 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  42.66 
 
 		 487 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  44.26 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  43.01 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.44 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.06 
 
 		 343 aa  288  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.16 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.56 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  41.19 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.9 
 
 		 385 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.24 
 
 		 425 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  43.26 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.9 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 480 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  42.06 
 
 		 478 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  42.67 
 
 		 417 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  42.18 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.39 
 
 		 420 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.38 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.46 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  42.22 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1672  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.24 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.789911  normal  0.0375366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0001  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.92 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0183219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  40.05 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  43.02 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1842  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.64 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  40.3 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0698  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.61 
 
 		 437 aa  276  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  45.66 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  40.8 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.39 
 
 		 417 aa  275  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 		 416 aa  276  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 417 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  41.65 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.19 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.43 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>