More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1672 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0698  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  86.99 
 
 		 437 aa  785    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  89.5 
 
 		 438 aa  811    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1672  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 		 438 aa  875    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.789911  normal  0.0375366 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1842  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  88.84 
 
 		 439 aa  806    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282265 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0001  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.33 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0183219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1738  isocitrate dehydrogenase  55.24 
 
 		 416 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.73457 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0703  isocitrate dehydrogenase  51.92 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0523745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.52 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.98 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.38 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.79 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.98 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.76 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.51 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.65 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.19 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.74 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.85 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.23 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.77 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.74 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.49 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.54 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  49.27 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  47.31 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  47.98 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  48.74 
 
 		 416 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.3 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  45.26 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  48.07 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.02 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  47.06 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  45.35 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  46.78 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  48.21 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  46.3 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  46.54 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  46.3 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.85 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  45.82 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  47.98 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  44.87 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  51.1 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.21 
 
 		 413 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0439  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  50 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.364858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  46.77 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  45.45 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  48.85 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1881  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.63 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.328566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.88 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  47.26 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  47.47 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  47.47 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  47.45 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.97 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  47.19 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  47.64 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  47.45 
 
 		 419 aa  362  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.56 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  47.7 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0618  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.59 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.03 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  46.04 
 
 		 422 aa  359  6e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  46.44 
 
 		 424 aa  359  6e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 420 aa  358  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  46.94 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.73 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  47.19 
 
 		 418 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.05 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  45.66 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  47.47 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  47.98 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  46.4 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>