More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02380 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  100 
 
 		 364 aa  734    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  70.11 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  57.26 
 
 		 359 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  56.98 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.7 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.47 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.26 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  55.03 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.96 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.06 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.2 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  53.22 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  50.56 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.83 
 
 		 334 aa  354  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.64 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.4 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  49.17 
 
 		 348 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  50.56 
 
 		 335 aa  345  8e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.89 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  50.28 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.26 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  50.84 
 
 		 335 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  48.33 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  48.33 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  48.33 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  47.38 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.7 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  48.33 
 
 		 335 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  47.78 
 
 		 335 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  47.38 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  47.38 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  47.38 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  47.38 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  46.83 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  46.56 
 
 		 335 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  46.56 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  46.39 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  47.66 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.55 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  49.58 
 
 		 334 aa  326  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  45.56 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  49.31 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.02 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.16 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.19 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  48.09 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.37 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.03 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  44.17 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.93 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  44.5 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.48 
 
 		 425 aa  292  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.01 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.97 
 
 		 344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  43.8 
 
 		 487 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.08 
 
 		 411 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.9 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  42.67 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  42.66 
 
 		 367 aa  282  6.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.39 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.23 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.97 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.73 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.73 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.73 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.1 
 
 		 586 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.69 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  42.06 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.39 
 
 		 418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 418 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 418 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1842  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.13 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  38.96 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0439  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.43 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.364858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  38.81 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.86 
 
 		 589 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  40.62 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0698  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.56 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  37.47 
 
 		 422 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  41.02 
 
 		 380 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.36 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.59 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3476  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.05 
 
 		 382 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.99614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  39.33 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.12 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  39.33 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  39.33 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  39.33 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  39.59 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  39.07 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  39.07 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>