More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2737 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  100 
 
 		 615 aa  1281    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  97.07 
 
 		 615 aa  1253    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.39 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  54.08 
 
 		 396 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.14 
 
 		 370 aa  310  4e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.27 
 
 		 403 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.89 
 
 		 339 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.34 
 
 		 339 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.17 
 
 		 337 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  50.47 
 
 		 237 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  34.43 
 
 		 335 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  33.87 
 
 		 361 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.75 
 
 		 343 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1368  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.08 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  34.6 
 
 		 340 aa  208  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.14 
 
 		 358 aa  208  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  33.06 
 
 		 336 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.8 
 
 		 331 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.42 
 
 		 360 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  34.53 
 
 		 335 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  34.34 
 
 		 336 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  34.34 
 
 		 336 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.15 
 
 		 239 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  34.34 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  34.81 
 
 		 335 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  34.62 
 
 		 336 aa  203  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  34.07 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 335 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.36 
 
 		 362 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.87 
 
 		 331 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 335 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 335 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 335 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  33.43 
 
 		 335 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 335 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.06 
 
 		 326 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  32.69 
 
 		 335 aa  198  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 336 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 		 336 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.26 
 
 		 334 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  35.62 
 
 		 323 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  34.89 
 
 		 336 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  34.3 
 
 		 360 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  32.38 
 
 		 377 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  33.43 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  32.91 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  33.43 
 
 		 335 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.15 
 
 		 334 aa  193  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.23 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  33.06 
 
 		 335 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  31.87 
 
 		 335 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  33.88 
 
 		 331 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  33.51 
 
 		 330 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.56 
 
 		 374 aa  191  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  31.58 
 
 		 333 aa  190  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  31.81 
 
 		 336 aa  190  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  33.24 
 
 		 330 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.34 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  31.49 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.43 
 
 		 329 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  33.51 
 
 		 330 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.58 
 
 		 375 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.15 
 
 		 335 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  32.7 
 
 		 487 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.85 
 
 		 359 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  35.33 
 
 		 330 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.07 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.44 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.87 
 
 		 375 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  33.16 
 
 		 348 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  31.99 
 
 		 481 aa  183  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  31.3 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  32.87 
 
 		 334 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  32.49 
 
 		 370 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  32.44 
 
 		 456 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.36 
 
 		 325 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.33 
 
 		 321 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  31.35 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.32 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  31.04 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  36.46 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.25 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  31.15 
 
 		 356 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  31.62 
 
 		 342 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.7 
 
 		 371 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  30.62 
 
 		 359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  32 
 
 		 348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  30.75 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.51 
 
 		 332 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.01 
 
 		 343 aa  174  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6279  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.38 
 
 		 363 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000172683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  30.35 
 
 		 359 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1124  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.72 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.13 
 
 		 331 aa  173  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  32.03 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  32.23 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.51 
 
 		 343 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  42.06 
 
 		 222 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.42 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>