280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3204 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  79.75 
 
 		 239 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  50.47 
 
 		 615 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  49.53 
 
 		 615 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  46.23 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.56 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.35 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.26 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.38 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.62 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  43.81 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.78 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.02 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.04 
 
 		 429 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.27 
 
 		 427 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  35.78 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.56 
 
 		 428 aa  98.6  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.49 
 
 		 428 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.16 
 
 		 413 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.21 
 
 		 429 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  28.64 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.7 
 
 		 426 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.02 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  30.77 
 
 		 545 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.48 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.57 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  30.17 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  30.89 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.03 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.5 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  27.09 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.43 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.59 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.45 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  27.7 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5774  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.78 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.02 
 
 		 438 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.5 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  28.08 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.5 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.78 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.5 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.68 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.27 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  29.19 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.96 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.54 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  27.05 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01570  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.17 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  32.78 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  26.73 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.34 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.65 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.16 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.5 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.61 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  27.62 
 
 		 529 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  28.88 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  27.06 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  27.62 
 
 		 509 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  27.62 
 
 		 509 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.37 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  28.96 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  25.71 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  28.74 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  27.88 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  27.44 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.72 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  25.71 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  25.71 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  25.66 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  25.93 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  28.5 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.47 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  27.5 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  23.71 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  26.07 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  31.43 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  30.1 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>