221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3716 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.37 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.07 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  37.44 
 
 
228 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 
227 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  33.18 
 
 
227 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 
227 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  33.18 
 
 
227 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.02 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.88 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.3 
 
 
615 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.3 
 
 
615 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  36.97 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.61 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  31.88 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.53 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.24 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.37 
 
 
429 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  33.48 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.11 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.55 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.64 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  32.26 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  31.19 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  30.92 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  34.29 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.55 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.59 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  32.2 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  33.57 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.02 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.92 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.17 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  38.39 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  29.7 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.47 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  36.51 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  26.7 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.77 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  28.16 
 
 
505 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  36 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  29.78 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  29.78 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  31.62 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  29.78 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  31.28 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  33.54 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  28.29 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  34.75 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.15 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.71 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.93 
 
 
437 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.65 
 
 
413 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  28.37 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.56 
 
 
439 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.78 
 
 
426 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  32.86 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  26.76 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  32.86 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  34.71 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  27.93 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  23.98 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3288  hypothetical protein  26.56 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  29.51 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  33.58 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 
229 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.73 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  37.07 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  31.85 
 
 
240 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.33 
 
 
427 aa  62  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.57 
 
 
438 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.53 
 
 
438 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  28.93 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.47 
 
 
428 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.92 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.83 
 
 
438 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.6 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_003296  RS03177  putative transferase protein  29.44 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  29.94 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  30.5 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.54 
 
 
450 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.65 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  33.04 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  32.63 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.01 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  30.15 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.41 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  30.15 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>