268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0894 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  96.92 
 
 
227 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5599  putative demethylmenaquinone methyltransferase  46.32 
 
 
228 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.74 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.36 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  28.91 
 
 
615 aa  94.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.38 
 
 
615 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3716  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.291445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.62 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  31.8 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  30.89 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  35.56 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.71 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  29 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  30.56 
 
 
529 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  30.56 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  39.71 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  30.56 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.33 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.71 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  27.48 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.54 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  27.11 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  29.37 
 
 
489 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.49 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.62 
 
 
220 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  25.71 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.21 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  30.85 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.62 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0626  putative methyltransferase  26.61 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0150946 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.12 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10700  DlpA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10940)  31.94 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  32.8 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.76 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  29.27 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  31.47 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  33.09 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.92 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.79 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  26.24 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.13 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.33 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.27 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.09 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  28.66 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  36.75 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.64 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.86 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  35.04 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.25 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  33.33 
 
 
532 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  36.52 
 
 
508 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  28.05 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  29.29 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  29.17 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  26.57 
 
 
505 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  32.37 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  38.32 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  29.93 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  30.63 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.24 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.65 
 
 
429 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  31.16 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  27.62 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  30.57 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  31.39 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  25.13 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.16 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.09 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  25.34 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  25.56 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  32.61 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.34 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  27.27 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  32.82 
 
 
133 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.09 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  37.74 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.86 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  25.87 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  31.34 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  24.12 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.66 
 
 
426 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  30.65 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.57 
 
 
429 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.53 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  24.59 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>