More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1224 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  81.7 
 
 		 223 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.9 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.01 
 
 		 236 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.97 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  40.1 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  35.82 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  38.54 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.17 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.34 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  40.96 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  37.56 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  35.07 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.5 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  41.08 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  36.55 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.84 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  35.91 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.32 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  34.8 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  36.13 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.93 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.86 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  42.94 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  35.57 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  35.12 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  39.68 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.41 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  44.03 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  33.67 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.57 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.42 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  34.78 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  35.26 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  37.7 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  33.87 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3395  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  33.9 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  39.58 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  37.28 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  35.18 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.13 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.13 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3657  putative 4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase  39.52 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.79 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  34.94 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.98 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.61 
 
 		 450 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.59 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.98 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.54 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  32.47 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  32.8 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.98 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  31.86 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  31.86 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.87 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  31.86 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.18 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  34.04 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.61 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.71 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.71 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  32.95 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.04 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.94 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  32.54 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  31.95 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  36.24 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.98 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.75 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.23 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.1 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  34.42 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  34.42 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.18 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  35.86 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.22 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  37.66 
 
 		 155 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.97 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.27 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.65 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  35.85 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.96 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  33.77 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.89 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  36.5 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.5 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>