More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3330 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 
187 aa  358  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  53.67 
 
 
450 aa  184  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.56 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.35 
 
 
196 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  45.3 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.36 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  52.45 
 
 
215 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.43 
 
 
225 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.86 
 
 
233 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  41.99 
 
 
212 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  39.33 
 
 
233 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  39.43 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.15 
 
 
225 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  38.2 
 
 
229 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.4 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  36.52 
 
 
246 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.04 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  38.59 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  36.72 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  38.76 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  46.15 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  38.2 
 
 
235 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  39.31 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.18 
 
 
232 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  39.88 
 
 
227 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  38.2 
 
 
224 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  46.75 
 
 
215 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  39.66 
 
 
227 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  45.64 
 
 
224 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  43.53 
 
 
213 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  37.14 
 
 
227 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  39.07 
 
 
227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.48 
 
 
231 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.26 
 
 
216 aa  118  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.88 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  38.71 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  38.71 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  38.71 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  41.71 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  35.84 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.89 
 
 
232 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.24 
 
 
212 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 
230 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  35.39 
 
 
225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  32.76 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.61 
 
 
231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  44.12 
 
 
222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.85 
 
 
237 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.71 
 
 
208 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  37.24 
 
 
238 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  42.95 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  36.57 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.05 
 
 
229 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  43.79 
 
 
222 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  37.24 
 
 
231 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  39.88 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  35.03 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.15 
 
 
224 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.57 
 
 
428 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  36.57 
 
 
227 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.07 
 
 
223 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.92 
 
 
224 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  34.83 
 
 
224 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.77 
 
 
429 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  36.72 
 
 
238 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.14 
 
 
228 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.06 
 
 
232 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.06 
 
 
232 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.71 
 
 
232 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 
232 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 
232 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 
232 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.78 
 
 
227 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.33 
 
 
219 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.43 
 
 
428 aa  101  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  37.95 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.32 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  33.58 
 
 
238 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  36.5 
 
 
237 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  38.29 
 
 
227 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.24 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  33.58 
 
 
238 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2468  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.18 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.85 
 
 
429 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.88 
 
 
204 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.87 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  32.85 
 
 
238 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 
232 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.57 
 
 
232 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.05 
 
 
428 aa  94  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.43 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.43 
 
 
426 aa  92  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 
224 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  36.15 
 
 
231 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.87 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>