More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1131 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 450 aa  852    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  53.67 
 
 		 187 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.68 
 
 		 209 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  42.74 
 
 		 263 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  51.96 
 
 		 196 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  44.38 
 
 		 225 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.2 
 
 		 232 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  44.86 
 
 		 224 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  39.34 
 
 		 225 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  40.76 
 
 		 224 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  48.37 
 
 		 212 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.13 
 
 		 233 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  46.25 
 
 		 224 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  41.62 
 
 		 224 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  47.4 
 
 		 215 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  42.37 
 
 		 233 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.97 
 
 		 231 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  49.08 
 
 		 208 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.08 
 
 		 225 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.77 
 
 		 232 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.77 
 
 		 232 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  42.86 
 
 		 212 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.78 
 
 		 231 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  47.78 
 
 		 228 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  47.43 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.61 
 
 		 229 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  47.43 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  43.78 
 
 		 224 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.63 
 
 		 232 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  42.8 
 
 		 261 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  43.98 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.63 
 
 		 231 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.7 
 
 		 232 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  42.93 
 
 		 224 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  48.03 
 
 		 222 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.7 
 
 		 232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 		 229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  40 
 
 		 262 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.94 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  46.71 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  43.6 
 
 		 223 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.3 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.2 
 
 		 230 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  38.33 
 
 		 237 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  44.07 
 
 		 232 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.16 
 
 		 232 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  38.1 
 
 		 231 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.09 
 
 		 229 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  52.05 
 
 		 227 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.26 
 
 		 223 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  41.46 
 
 		 235 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  36.11 
 
 		 246 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.81 
 
 		 225 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  48.89 
 
 		 203 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  37.29 
 
 		 229 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  36.81 
 
 		 237 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  36.81 
 
 		 237 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  36.81 
 
 		 237 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.64 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  44.44 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  48.15 
 
 		 203 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.46 
 
 		 216 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  41.14 
 
 		 216 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  39.84 
 
 		 262 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  45.7 
 
 		 215 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  37.24 
 
 		 227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.61 
 
 		 219 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  37.43 
 
 		 235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.61 
 
 		 212 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.34 
 
 		 205 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.87 
 
 		 237 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  34.24 
 
 		 228 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.71 
 
 		 224 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.59 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.11 
 
 		 224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  38.67 
 
 		 227 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  36.42 
 
 		 227 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  38.15 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  36.42 
 
 		 227 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.99 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  41.76 
 
 		 238 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 		 198 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.92 
 
 		 204 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  37.65 
 
 		 224 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 		 207 aa  106  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  41.21 
 
 		 238 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.05 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  41.76 
 
 		 238 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.88 
 
 		 206 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.14 
 
 		 277 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  37.21 
 
 		 227 aa  103  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  37.24 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.55 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  38.95 
 
 		 244 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>