More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00687 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  63.9 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  62.19 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  55.67 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  54.73 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  52.36 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.56 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  34.48 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.87 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.7 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.88 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.4 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 		 450 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.51 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 		 232 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.5 
 
 		 438 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.78 
 
 		 438 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  32.51 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.93 
 
 		 438 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.39 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.39 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.42 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.46 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35.93 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  33.53 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  39.53 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.75 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.23 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  32.78 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.07 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  35.67 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.44 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.87 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.49 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  33.88 
 
 		 225 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  32.51 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  97.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  38.85 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  37.33 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.85 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.65 
 
 		 429 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  35.9 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.9 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  35.06 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  33.14 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  34.12 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.48 
 
 		 437 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.57 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.84 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.46 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.34 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.28 
 
 		 413 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.43 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.69 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.3 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.26 
 
 		 428 aa  91.7  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.72 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.72 
 
 		 429 aa  90.5  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  30.95 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.88 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  39.86 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  35.17 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.8 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.99 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.67 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.67 
 
 		 428 aa  88.6  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  38.04 
 
 		 244 aa  88.2  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.57 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33 
 
 		 426 aa  87.8  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  35.68 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.67 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  36.71 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.94 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.41 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.94 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.94 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.69 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.41 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  30.21 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  35.92 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.16 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.29 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  34.29 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  34.29 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.97 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  32 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>