More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1928 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  53.89 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  51.78 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  52.36 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  47.92 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.19 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.12 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.17 
 
 		 438 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 		 231 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  35.8 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.17 
 
 		 438 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.16 
 
 		 438 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.33 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.26 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.64 
 
 		 229 aa  101  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.94 
 
 		 450 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  34 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.93 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  38.06 
 
 		 413 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  31.67 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.67 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  32.52 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.59 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  35.03 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.92 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.29 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.65 
 
 		 437 aa  94.7  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.75 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  31.21 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.65 
 
 		 246 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.26 
 
 		 233 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.01 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.7 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.83 
 
 		 428 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.75 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  35.86 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  32.96 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.06 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.91 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  33.12 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  31.84 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.56 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.74 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.21 
 
 		 234 aa  88.6  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  38.78 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.75 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  88.2  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.96 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  33.15 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  32.72 
 
 		 237 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  32.72 
 
 		 237 aa  87.8  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  32.72 
 
 		 237 aa  87.8  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.73 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  28.81 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.06 
 
 		 429 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  38.52 
 
 		 429 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.74 
 
 		 428 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.27 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  31.94 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  32.57 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  35.06 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.35 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.3 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.36 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  35.33 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.62 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  31.9 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  35.23 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.88 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  34.68 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4462  4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate aldolase, putative  36.13 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.34 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  34.53 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.49 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  35.58 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  40.52 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  37.96 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  31.79 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  40.31 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.32 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.25 
 
 		 427 aa  82.4  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>