More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5802 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  76.42 
 
 		 229 aa  353  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  65.77 
 
 		 231 aa  298  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  67.4 
 
 		 228 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  59.56 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  58.67 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  60.89 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  56.83 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  55.6 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  55.6 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  59.05 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  59.05 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  54.63 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  54.5 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  43.27 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.72 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  46.75 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  39.35 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  44.72 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  38.35 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.1 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  45.65 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.46 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.63 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.35 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  34.91 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.14 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.09 
 
 		 450 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.43 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  45 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  39.18 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.84 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  44.38 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  39.5 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.41 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  37.11 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  40.62 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  43.21 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.22 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.95 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.68 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  36.69 
 
 		 212 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.94 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  33.5 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.63 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.69 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  41.36 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.68 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.11 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.38 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  34.03 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  46.51 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.51 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.46 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.27 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.18 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.88 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  31.75 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.61 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.62 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.4 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.31 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.65 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  31.66 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  31.66 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  31.66 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  34.09 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.07 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  32.09 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.41 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  32.82 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  33.86 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  34.81 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.33 
 
 		 413 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.15 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.71 
 
 		 429 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.7 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.02 
 
 		 429 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.33 
 
 		 428 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  34.9 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  37.63 
 
 		 427 aa  96.7  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  29.44 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  34.92 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.64 
 
 		 426 aa  95.9  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.35 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  34.92 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  32.32 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.91 
 
 		 428 aa  95.1  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.81 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  31.91 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.58 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.67 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>