More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0647 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  100 
 
 
429 aa  863    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  63.55 
 
 
428 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  63.93 
 
 
428 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  62.15 
 
 
429 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  62.12 
 
 
428 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  59.52 
 
 
413 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  57.94 
 
 
427 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.66 
 
 
426 aa  457  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.35 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  48.48 
 
 
438 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  47.31 
 
 
438 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  47.54 
 
 
438 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  40 
 
 
207 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  39.71 
 
 
211 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.2 
 
 
225 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36 
 
 
240 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  38.66 
 
 
228 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  37.14 
 
 
211 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.32 
 
 
211 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  36.23 
 
 
212 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  36.71 
 
 
210 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.74 
 
 
209 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.35 
 
 
222 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.21 
 
 
227 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.92 
 
 
210 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.92 
 
 
210 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  36.32 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  40.91 
 
 
217 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.3 
 
 
210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.3 
 
 
210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.64 
 
 
450 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.42 
 
 
229 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1830  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.91 
 
 
221 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000143542  normal  0.0955115 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.86 
 
 
217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 
225 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1686  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.71 
 
 
221 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0279692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.7 
 
 
219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  35.42 
 
 
224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  33.65 
 
 
215 aa  110  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  33.65 
 
 
215 aa  110  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 
232 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  31.6 
 
 
615 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.64 
 
 
192 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.51 
 
 
403 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  30.5 
 
 
235 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.77 
 
 
187 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.03 
 
 
198 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  32.06 
 
 
615 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.7 
 
 
230 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.14 
 
 
234 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.07 
 
 
233 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.58 
 
 
396 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
224 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  29.02 
 
 
216 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.66 
 
 
233 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.65 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 
239 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  33.52 
 
 
246 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.39 
 
 
216 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  32.61 
 
 
225 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.68 
 
 
229 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.71 
 
 
235 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.76 
 
 
229 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 
224 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.37 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.07 
 
 
203 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.19 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  31.72 
 
 
212 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.09 
 
 
236 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  28.07 
 
 
203 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  29.81 
 
 
222 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 
209 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 
225 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.36 
 
 
275 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  29.84 
 
 
223 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  39.26 
 
 
227 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.58 
 
 
224 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.75 
 
 
231 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.3 
 
 
212 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.47 
 
 
224 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.23 
 
 
224 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.4 
 
 
231 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.69 
 
 
393 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
231 aa  91.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.72 
 
 
207 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.58 
 
 
213 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.32 
 
 
206 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.62 
 
 
214 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 
208 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  34.76 
 
 
227 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 
232 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.99 
 
 
232 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 
232 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>