88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1830 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1830  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000143542  normal  0.0955115 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  66.2 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  66.82 
 
 		 217 aa  278  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1686  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  66.06 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0279692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.09 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  40.91 
 
 		 429 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  35.21 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.74 
 
 		 426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.91 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  36.14 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.73 
 
 		 393 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.27 
 
 		 393 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.18 
 
 		 428 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.34 
 
 		 428 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  31.36 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  34.65 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.76 
 
 		 393 aa  101  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.65 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.65 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.18 
 
 		 392 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.49 
 
 		 429 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.16 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.16 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.84 
 
 		 403 aa  98.2  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.17 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.66 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.82 
 
 		 427 aa  94  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0372  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.78 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  34.5 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  34.5 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.85 
 
 		 396 aa  92.8  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.96 
 
 		 393 aa  92  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.05 
 
 		 392 aa  91.7  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.4 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.84 
 
 		 437 aa  89  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.84 
 
 		 438 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  30.93 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.77 
 
 		 438 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3937  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  32.51 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.33 
 
 		 428 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.91 
 
 		 438 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  31.89 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3953  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  32.34 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3998  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  32.34 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.92923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3873  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  32.34 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3893  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.82 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4060  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  31.84 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3889  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  31.84 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3696  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.54 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0131  hexulose-6-phosphate synthase  25.98 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03384  hypothetical protein  30.35 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03433  3-keto-L-gulonate 6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3785  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4078  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0129  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0133  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3904  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0771  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.65 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.366407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04025  hypothetical protein  30.58 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04063  3-keto-L-gulonate 6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4440  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4757  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4667  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5712  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3817  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3797  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0987  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.14 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4726  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.58 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.491021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4664  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4747  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4804  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4654  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4783  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0115  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.38 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0197016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0292  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.21 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0127  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0145  3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1812  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  31.34 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.36 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1994  3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase  28.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.79 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.19 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>