227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0290 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0290  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1004  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  95.28 
 
 
212 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1624  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  94.81 
 
 
212 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.904613  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1474  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  79.33 
 
 
211 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0073  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  66.2 
 
 
219 aa  279  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.690907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0060  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50 
 
 
221 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.53 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2545  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.71 
 
 
225 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1139  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.89 
 
 
209 aa  185  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00457344  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2350  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.54 
 
 
211 aa  180  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0629  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.57 
 
 
234 aa  176  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0153  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  43.46 
 
 
212 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0683456  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0183  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.59 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0028  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
216 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684856  normal  0.332219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1680  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1966  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  31.43 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1147  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1063  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.33 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1418  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.58 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0023  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.04 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2155  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.59 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0753  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.4 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0031  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.8 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1332  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.56 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0027  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.06 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.44 
 
 
242 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0430  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.45 
 
 
279 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.57 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.57 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1571  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.98 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0574999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2761  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.11 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.85 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.94 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.32 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0254023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.08 
 
 
271 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1687  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.61 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.660624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1179  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.66 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2890  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.12 
 
 
240 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.88 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  27.1 
 
 
210 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0924  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.82 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1335  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.69 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.31 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.57 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.33 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.87 
 
 
278 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  29.05 
 
 
276 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0387  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.42 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2920  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  27.23 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.21 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1577  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  23.21 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.94 
 
 
275 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.26 
 
 
258 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1724  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.45 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.297453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.84 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.94 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.94 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.93 
 
 
274 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.26 
 
 
271 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.25 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.5 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.32 
 
 
309 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1278  orotidine-5'-phosphate decarboxylase  23.95 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  28.3 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  26.7 
 
 
513 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1862  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.96 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0932459  normal  0.0318257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.64 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0542  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.71 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.64 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.99 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.97 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1799  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.57 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.26 
 
 
271 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.15 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0195  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.6 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3839  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.14 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.99 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.87 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1688  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.31 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0654719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  28.57 
 
 
274 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.97 
 
 
284 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1299  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  22.71 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.16 
 
 
274 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  25.82 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.68 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.15 
 
 
272 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13821  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.76 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.03 
 
 
287 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.11 
 
 
264 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0730  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.78 
 
 
234 aa  52  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000744541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.15 
 
 
274 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.26 
 
 
274 aa  51.6  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  24.76 
 
 
280 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  24.29 
 
 
274 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>